Anak dengan autism memiliki gangguan perilaku, yaitu perilaku berlebih dan perilaku berkekurangan. Perilaku berlebih tersebut seperti memukul, menyakiti diri sendiri atau menyakiti orang lain. Sedangkan perilaku berkekurangan seperti belum adanya kontak mata, belum paham perintah dan belum mampu mengontrol diri terhadap emosi. Untuk memperbaiki perilaku yang berlebih atau berkekurangan tersebut dibutuhkan adanya terapi perilaku. Pelayanan terapi perilaku dilaksanakan setiap hari Senin – Jum’at, dimulai dari jam 08.00 – 15.00 WIB dan diampu oleh 2 terapist perilaku. Dua therapist ini menangani 14 anak dengan autism berdasarkan jadwal yang telah ditentukan oleh tim.